In der bisherigen 2-stufigen genomischen Zuchtwertschätzung (gZWS) wird die Leistungsfähigkeit maßgeblich von der verfügbaren Anzahl von geprüften Stieren bestimmt. Bei der Einführung der gZWS im Dezember 2010, war die Typisierung mit rund € 200 vergleichsweise teuer. Daher wurden in den einzelnen Ländern große finanzielle Anstrengungen unternommen, vor allem die informativsten Tiere, die geprüften Altstiere, zu genotypisieren. Große Rinderpopulationen, wie sie bei der Rasse Holstein Friesian vorliegen, konnten über internationale Kooperationen Kalibrierungsstichproben von über 30.000 Stieren etablieren.

Um die Kalibrierungsstichproben auch bei kleineren Populationen wie dem Fleckvieh oder dem Braunvieh zu vergrößern, ist die Genotypisierung von weiblichen Tieren eine interessante Möglichkeit. Genomzuchtwerte von weiblichen Jungtieren können zur innerbetrieblichen Selektion und für das Management genutzt werden, wodurch die Kosten der Bestandesergänzung reduziert werden oder durch gezielte Paarung über Anpaarungsprogramme betriebsspezifische Zuchtziele konsequenter verfolgt werden können. In der gZWS können genotypisierte Kühe mit Eigenleistung in die Kalibrierung einbezogen werden und tragen somit zur Steigerung der Vorhersagekraft der Zuchtwertschätzung bei. Hier kann in den letzten Jahren eine äußerst dynamische Entwicklung in vielen Ländern beobachtet werden. In den USA kann bei der Rasse Holstein Friesian bereits heute auf eine Kuhlernstichprobe von über 500.000 Tieren zurückgegriffen werden. Das ist im Wettbewerb der Rassen in Verbindung mit dem großen Pool von geprüften Stieren ein entscheidender Vorteil.

Besonders wichtig wird die Genotypisierung von weiblichen Tieren bei Merkmalen die erst seit kurzer Zeit erhoben werden. Ein Beispiel hierfür sind direkte Gesundheitsmerkmale auf der Basis von tierärztlichen Diagnosen und/oder Beobachtungen durch den Tierhalter. Hier ist der Aufbau einer Kalibrierung über geprüfte Stiere ein langwieriger Prozess der mindestens 10 bis 15 Jahre in Anspruch nimmt. Über die direkte Einbeziehung von genotypisierten Kühen, die für das Merkmal unter Leistungskontrolle stehen, kann hingegen innerhalb weniger Jahre eine genomische Zuchtwertschätzung etabliert werden.

Die Frage, ob und wie umfangreich weibliche Tiere mit Phänotypendaten genotypisiert werden, ist damit zu einem entscheidenden strategischen Faktor im Wettbewerb zwischen Rinderpopulationen geworden. Neben den in vielen Ländern beobachteten Tendenzen, dass Züchter genomische Zuchtwerte immer stärker für das Betriebsmanagement nutzen und daher die gesamte weibliche Nachzucht typisieren, gibt es in einigen Ländern inzwischen Projekte zur systematischen Genotypisierung von weiblichen Tieren. Das Ziel ist hier der Aufbau einer Kuhlernstichprobe, häufig mit dem Schwerpunkt auf Gesundheitsmerkmale. Als Beispiele können hier die Projekte KuhVision bei der Rasse Holstein Friesian (ab 2016), sowie Braunvieh Vision beim Braunvieh (ab 2017), FLEQS (ab 2019) und Fleckficcient (ab) bei Fleckvieh genannt werden.